W przededniu obchodów jubileuszu 25-lecia Pontyfikatu Jana Pawła II Wydział Teologiczny UMK w Toruniu uroczyście rozpoczął trzeci rok swojej działalności. Mszy św. w kaplicy Wyższego Seminarium Duchownego w Toruniu przewodniczył biskup toruński dr Andrzej Suski, Wielki Kanclerz Wydziału Teologicznego. W homilii poświęconej Jezusowej szkole modlitwy podkreślił, że teologiem może zostać tylko ten, kto się modli. Człowiek, który się modli, rozumie w sprawach Bożych więcej. Modlitwa pozawala rozwijać się w miłości, a miłość pomaga w rozumieniu i pójściu w głąb Bożych tajemnic. Modlitwa jest konieczna, aby zdjąć przed Panem Bogiem sandały pychy, napuszonej pewności siebie i zbliżyć się do Bożych prawd z szacunkiem i pełnym zachwytu zdumieniem. Modlitwa zmusza do wyrzeczenia się zarozumiałości, tej podstawowej przeszkody w poznawaniu Pana Boga.
Ważnym przypomnieniem, szczególnie dla profesorów i wykładowców, było stwierdzenie, że pragnienie modlitwy obudziło się w sercach uczniów, kiedy patrzyli na rozmodlonego Jezusa. Prosili oni: „Panie, naucz nas modlić się”, widząc, że ich Nauczyciel się modli, że na modlitwie spędza niejedną noc. Końcowe życzenia Księdza Biskupa zawarte były w słowach modlitwy pisarza: „Panie, spraw, abym nie zadowalał się wiedzą, gromadzeniem idei, szkicowaniem rozważań o Tobie, szafowaniem definicjami, odpowiedziami, nawet uczonymi dokumentami, świetnymi dowodami. Wiem doskonale, że nigdy nie potrafię Cię posiąść nawet dzięki książkom, które czytam i nad którymi niszczę sobie wzrok. Ale mam niesłychaną możliwość pozwolenia Ci, byś Ty mnie posiadł. Spraw, Boże, by dzięki studiom powiązanym z intensywną modlitwą, ten kto się zbliży do mnie, mógł zauważyć, że to nie ja zdobyłem wiedzę, ale że zostałem zdobyty przez Ciebie”.
Druga część inauguracji odbyła się w auli UMK. Chór alumnów Wyższego Seminarium Duchownego w Toruniu pod kierunkiem ks. mgr. Wojciecha Wierzbickiego zaśpiewał pieśń Gaude Mater Polonia. Dziekan wydziału - ks. prof. Jerzy Bagrowicz, otwierając nowy rok akademicki, podkreślił szczególny charakter tej inauguracji. Łączy się ona z 25. rocznicą Pontyfikatu Papieża, który szczególnie kocha ludzi młodych. Jest dla nich autorytetem, przede wszystkim dlatego, że jest świadkiem Chrystusa. Ksiądz Dziekan życzył studentom m. in., aby docenili łaskę życia w wyjątkowej dla Kościoła epoce, aby papieskie zawołanie: „Nie lękajcie się!” zamieniali na życie zgodne z Ewangelią, i aby nie brakło im odwagi podejmowania wyzwań aktywnej obecności i służby w Kościele.
Prorektor UMK - prof. Andrzej Radzimiński powiedział, że na współczesnym uniwersytecie trudno sobie wyobrazić kształcenie humanistyczne bez teologii. Wyraził radość z powrotu do tradycji klasycznego uniwersytetu, w którym teologia była królową nauk.
Wykład inauguracyjny wygłosił ks. dr hab. Zdzisław Pawlak, rektor Wyższego Seminarium Duchownego we Włocławku. W kontekście papieskiego jubileuszu mówił nt. genezy antropologii filozoficznej Karola Wojtyły. Przypomniał, że źródłem tej integralnej wizji człowieka było dla przyszłego Papieża studium mistyki św. Jana od Krzyża, metafizyki św. Tomasza z Akwinu i fenomenologii Maxa Schelera.
Chór Wydziału Teologicznego „Tibi Domine” pod kierunkiem ks. dr. Mariusza Klimka wykonał utwór krakowskiego kompozytora Juliusza Łuciuka Oremus pro Pontifice nostro Joanne Paolo II. Następnie studenci I roku studiów dziennych i zaocznych złożyli ślubowanie i otrzymali indeksy z rąk prodziekana prof. Ireneusza Mikołajczyka.
Duszpasterz Wydziału Teologicznego - ks. mgr lic. Marian Tomasz Kowalski przedstawił bardzo bogatą propozycję form pracy duszpasterstwa akademickiego. Bp Andrzej Suski przypomniał bezprecedensowe wydarzenie z 7 czerwca 1999 r. W auli toruńskiego Uniwersytetu Jan Paweł II spotkał się ze światem polskiej nauki. Ojciec Święty wskazał wtedy m.in. na potrzebę pracy na rzecz pojednania rozumu i wiary. Ksiądz Biskup podkreślił, że to wielkie wyzwanie współczesności powinien podjąć przede Wydział Teologiczny UMK.
Dziekan wydziału - ks. prof. Jerzy Bagrowicz przeczytał telegram do Jana Pawła II: Ojcze Święty, Pracownicy naukowo-dydaktyczni i administracyjni oraz studenci Wydziału Teologicznego Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu, zgromadzeni na uroczystej inauguracji pracy Wydziału w roku akademickim 2003/2004, w obecności Wielkiego Kanclerza Wydziału - Księdza Biskupa dr. Andrzeja Suskiego, w obecności Władz Uniwersytetu, łączą się z Waszą Świątobliwością w dziękczynieniu Bogu za 25 lat Pontyfikatu. Ze szczególną wdzięcznością myślimy o obecności Waszej Świątobliwości w Toruniu i na Uniwersytecie Mikołaja Kopernika w dniu 7 czerwca 1999 r. Przesłanie Waszej Świątobliwości wygłoszone w auli Uczelni na spotkaniu ze światem polskiej nauki jest dla nas ciągle światłem i źródłem inspiracji. Życzymy Waszej Świątobliwości wiele sił, zdrowia i światła Ducha Świętego w posługiwaniu Kościołowi i światu. Naszą wdzięczność i życzenia łączymy z modlitwą w intencji Waszej Świątobliwości. Uczestnicy inauguracji przyjęli treść telegramu gromkimi oklaskami. Na zakończenie chór alumnów Wyższego Seminarium Duchownego w Toruniu zaśpiewał tradycyjne Gaudeamus igitur.
Warto zauważyć, że zainteresowanie studiowaniem teologii w Toruniu nie maleje. Podobnie jak w roku ubiegłym limit przyjętych na pierwszy rok studiów dziennych zwiększono ze 150 do 180 osób. Egzaminy wstępne zdawało ponad 320 osób. Od grudnia 2002 r. Wydział Teologiczny ma prawo nadawania doktoratów. Od tej pory obroniono trzy prace doktorskie. Obecnie na kursie ad lauream, koniecznym do przedłożenia rozprawy doktorskiej, studiuje 28 osób.